據日本警方統計，每年僅提交申請的失蹤人口就達10萬人，其中9萬人的行蹤可疑確認，但仍有1萬人下落不明。位于遠郊的一座深山叢林，似乎具有著強烈的魔性，無數人進入這里，從此消失無蹤。少女繭（日南響子 飾）偶然和父親目擊一輛綁架了少女的車，父女倆一路追蹤，走上了不歸之途；家庭主婦真奈（桐島れいか 飾）十年前曾在林中丟失長女，如今他的小女兒阿櫻離家上學后也一去不返；正在拍攝恐怖電影的新人女演員麗奈（飛鳥凜 飾）結束工作后，不得不穿越那座恐怖的森林，其中的景象與聲音令她戰栗不已；小女孩薰（藤本七海 飾）受托照顧鄰家的孩子，可是她卻遭遇了一個恐怖的人形。　　不同的人，不同的故事，同樣的恐怖……

 在風景秀麗，氣候宜人的王冠市，即將舉行神奇寶貝足籃世界杯比賽，屆時，大批的觀眾和訓練師會涌入此處，整個城市將會陷入一片歡樂的海洋之中。小智（松本梨香 配音）一行人正在前往王冠市的路上，旅途中，他們遇見了名為索羅亞的神秘神奇寶貝，它不僅能夠幻化成人類的姿態，還能夠通過心電感應和人類交流。小智和索羅亞結伴前行，哪知道王冠市竟然發生了神奇寶貝暴動事件，雷公、炎帝和水君本是城市的守護神，卻不知為何向市民們發起了進攻，城市之中一片混亂景象。這一切的始作俑者是名為克林克斯（陣內孝則 配音）的企業家，而他亦是索羅亞想要尋找的同伴。

影片通過跨越數千年、不同時空的三條故事線，交織出無形之中彼此呼應的科幻寓言。

　　年輕的貢嘎和他的表弟巴特在一個廢品場里意外發現了一個裝滿生銹十字架的手提箱。巴特靈機一動，決定將這些十字架改造成霓虹十字架，并逐戶向第比利斯的居民推銷。他們在城市郊區的漫游因此變成了一場尋找愛情與友情的冒險。